Τα δυο τμήματα έχουν  σημαντική διαφορά τόσο στα προγράμματα σπου δών όσο και στα επαγγλεματικά δικαιώματα.

Στο Τμήμα του ΕΚΠ τα προγράματα σπουδών περιλαμβάνουν γνώσεις από τις πολιτικές επιστήμες, την κοινωνιολογία, την Ιστορία, τη Νομική, τις διεθνέις σχέσεις και κάποια στοιχεια από τη Διοίκηση, εφόσον επιλεγεί η αντίστοιχη κατεύθυνση (για να δείς αναλυτικά το πρόγραμμα σπουδών κάνε κλικ εδώ) ενώ το τήμα της Παντείου δίδει έμφαση κυρίως σε γνώσεις των επιστημών της Οικονομίας και Διοίκησης (κάνε κλικ εδώ για περισσότερα).

Αυτό έχει σαν συνέπεια βέβαια, το τμήμα της Παντείου, να είναι περισσότερο  στραμμένο στην αγορά εργασίας και τις ανάγκες της (δίδει το επαγγελματικό δικαίωμα της εγγραφής στο Οικονομικό ΕΠιμελητήριο) σε αντίθεση με αυτό του ΕΚΠ που από μόνο του δεν κατοχυρώνει κάποιο ιδιαίτερο επαγγελματικό δικαίωμα. H φοίτηση σ' αυτό, αποτελεί τη βάση για μια σειρά από μεταπτυχιακά όπως η Ευρωπαϊκή Διπλωματία ή η Δημόσια Διοίκηση. Οι απόφοιτοί του, έχουν και το επαγγελματικό δικαίωμα να διεκδικήσουν θέση στις δημόσια εκπαίδευση, σε αντιθεση με αυτούς του τμήματος της Παντειου.

Τέλος, όπως όλοι οι απόφοιτοι της τριτοβάθμιας εκπαίδευσης, μπορούν οι πτυχιούχοι και των 2 τμημάτων να διεκδικήσουν, μέσω διαγωνισμού, την είσοδό τους δε διοικητικούς οργανισμούς της Ε.Ε. ή εδώ στην Ελλαδα της είσοδό τους, στην Εθνική Σχολή Δημόσιας Διοίκησης (που σημαίνει και αυτόματο διορισμό στο δημόσιο). ΣΥγκριτικά, βοηθιούνται περισσότερο οι πτυχιούχοι της Παντείου, λόγω του ότι τα εξταζόμενα μαθήματα υπάρχουν μέσα στο πρόγραμμα σπουδών.